Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb6Q9Z0T9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb6Q9Z0T9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms