Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms