Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms