Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PapolbQ9WVP6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms