Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme4Q9WV84 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme4Q9WV84 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms