Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms