Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ramp3Q9WUP1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ramp3Q9WUP1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms