Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms