Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms