Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms