Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms