Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms