Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms