Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed2Q9R0Q3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms