Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpxQ9R0M3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms