Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b2Q9R0K7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b2Q9R0K7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms