Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod3Q9R0E1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod3Q9R0E1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms