Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vav3Q9R0C8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav3Q9R0C8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms