Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamc3Q9R0B6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms