Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a4Q9QZR9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a4Q9QZR9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms