Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms