Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Clcf1Q9QZM3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clcf1Q9QZM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms