Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmlQ9QZD5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms