Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh11Q9QYF1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms