Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp3Q9QY23 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms