Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxe3Q9QY14 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms