Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Opn4Q9QXZ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Opn4Q9QXZ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn4Q9QXZ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms