Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip4Q9QXN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip4Q9QXN3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms