Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg2Q9QXK3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms