Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trp53inp1Q9QXE4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms