Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clca3a1Q9QX15 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms