Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Homer2Q9QWW1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms