Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcea2Q9QVN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms