Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk3Q9QUN9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms