Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolkQ9QUG2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms