Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms