Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc2lQ9JME7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc2lQ9JME7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc2lQ9JME7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc2lQ9JME7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc2lQ9JME7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms