Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt1Q9JMD1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms