Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Reep6Q9JM62 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep6Q9JM62 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms