Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf1Q9JM58 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms