Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms