Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms