Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TefQ9JLC6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TefQ9JLC6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms