Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsmQ9JL96 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsmQ9JL96 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms