Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace2Q9JL18 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace2Q9JL18 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms