Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot9Q9JKY0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms