Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb3Q9JKS4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms