Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrac1Q9JKP8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms