Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms