Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms